黄河内蒙古段二期防洪工程涉及我区沿黄6个盟市和2个厅直属工程管理单位（黄管局、镫口局）。2015年11月10日，自治区发展改革委以内发改农字〔2015〕1446号文件批复该工程初步设计。总投资44.95亿元，其中中央预算内投资28.18亿元，自治区配套资金8.52亿元，盟市配套资金8.25亿元，施工总工期3年。

工程于2015年底开工建设，2016年下达投资计划16.00亿元,2017年下达投资计划20.00亿元,现累计完成投资34.79亿元，投资计划完成率96.6%，工程总体建设进度较好。完成的主要建设内容为堤防加培118.2km、顺堤河治理130.2km、垂直防渗墙6km、压浸平台63.1km、反压平台36.1km、背水侧平台5.9km、堤防护坡116.0km、植物护坡31.9km、堤顶路面349.1km、护堤林51.2km，河道整治工程66处、整治长度105.9km。